Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC10P48553 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAPPC10P48553 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms