Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSFP46459 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NSFP46459 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NSFP46459 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NSFP46459 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NSFP46459 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSFP46459 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSFP46459 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NSFP46459 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSFP46459 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms