Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
RANGAP1P46060 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RANGAP1P46060 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RANGAP1P46060 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms