Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GGCXP38435 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GGCXP38435 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GGCXP38435 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GGCXP38435 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GGCXP38435 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GGCXP38435 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms