Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FDFT1P37268 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FDFT1P37268 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms