Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TGFBR1P36897 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms