Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SFTPDP35247 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SFTPDP35247 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms