Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA4P34932 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA4P34932 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms