Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HOXD11P31277 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 VN1R11P-201ENST00000407795 868 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC109466.1-203ENST00000524297 1083 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC084759.2-202ENST00000557976 1053 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 WBP1LP6-201ENST00000438434 424 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CARD8-224ENST00000522431 622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AP005597.1-201ENST00000534192 802 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXD11P31277 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms