Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CLIP1P30622 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CLIP1P30622 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CLIP1P30622 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CLIP1P30622 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CLIP1P30622 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CLIP1P30622 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms