Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ECHS1P30084 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ECHS1P30084 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms