Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALRP27797 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALRP27797 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CALRP27797 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CALRP27797 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CALRP27797 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CALRP27797 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CALRP27797 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CALRP27797 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CALRP27797 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CALRP27797 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms