Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSMA3P25788 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSMA3P25788 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms