Protein–RNA interactions for Protein: P23497

SP100, Nuclear autoantigen Sp-100, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP100P23497 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SP100P23497 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SP100P23497 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SP100P23497 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SP100P23497 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SP100P23497 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SP100P23497 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SP100P23497 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SP100P23497 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms