Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RPS6KB1P23443 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPS6KB1P23443 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms