Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PVALBP20472 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PVALBP20472 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PVALBP20472 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PVALBP20472 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PVALBP20472 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms