Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CXCL3P19876 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms