Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GATA1P15976 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GATA1P15976 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA1P15976 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GATA1P15976 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GATA1P15976 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GATA1P15976 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms