Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RARAP10276 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RARAP10276 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RARAP10276 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RARAP10276 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RARAP10276 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARAP10276 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RARAP10276 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RARAP10276 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RARAP10276 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RARAP10276 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms