Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EDN1P05305 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EDN1P05305 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EDN1P05305 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDN1P05305 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EDN1P05305 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EDN1P05305 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms