Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
APOA2P02652 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
APOA2P02652 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
APOA2P02652 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
APOA2P02652 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms