Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5LO95447 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5LO95447 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5LO95447 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LCA5LO95447 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LCA5LO95447 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms