Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VAPBO95292 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAPBO95292 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAPBO95292 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAPBO95292 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VAPBO95292 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VAPBO95292 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
VAPBO95292 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VAPBO95292 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAPBO95292 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAPBO95292 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAPBO95292 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAPBO95292 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VAPBO95292 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms