Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCNKO75909 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCNKO75909 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCNKO75909 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCNKO75909 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCNKO75909 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms