Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRAPPC3O43617 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC3O43617 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms