Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATMINO43313 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMINO43313 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMINO43313 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMINO43313 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATMINO43313 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATMINO43313 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATMINO43313 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATMINO43313 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATMINO43313 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms