Protein–RNA interactions for Protein: O43290

SART1, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SART1O43290 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SART1O43290 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SART1O43290 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SART1O43290 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SART1O43290 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SART1O43290 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SART1O43290 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SART1O43290 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SART1O43290 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SART1O43290 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SART1O43290 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms