Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H3BQF6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H3BQF6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H3BQF6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H3BQF6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
H3BQF6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H3BQF6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQF6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQF6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQF6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQF6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H3BQF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H3BQF6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms