Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PRRT4C9JH25 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRT4C9JH25 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
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