Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTLL13PA6NNM8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TTLL13PA6NNM8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms