Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VWA8A3KMH1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VWA8A3KMH1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VWA8A3KMH1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms