Protein–RNA interactions for Protein: A0PK11

CLRN2, Clarin-2, humanhuman

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLRN2A0PK11 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLRN2A0PK11 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLRN2A0PK11 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
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