Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQJ8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQJ8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms