Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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