Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 DDX23-213ENST00000552369 603 ntTSL 413.29□□□□□ -0.285e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-218ENST00000553182 779 ntTSL 313.29□□□□□ -0.285e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.665e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-207ENST00000550834 869 ntTSL 510.78□□□□□ -0.685e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-202ENST00000547135 1377 ntTSL 29.96□□□□□ -0.825e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 59.57□□□□□ -0.885e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 DDX23-214ENST00000552512 696 ntTSL 49.19□□□□□ -0.945e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 47.82□□□□□ -1.165e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GIGYF2-237ENST00000482952 618 ntTSL 25.5□□□□□ -1.535e-10■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.654e-17■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PARP6-210ENST00000566844 829 ntTSL 220.1■□□□□ 0.814e-17■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 CRKL-202ENST00000411769 2037 ntTSL 1 (best)19.63■□□□□ 0.731e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.058e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.528e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.598e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PARP6-218ENST00000568360 596 ntTSL 59.5□□□□□ -0.894e-17■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 KIF20A-202ENST00000502338 600 ntTSL 34.84□□□□□ -1.638e-11■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 MAP4K3-203ENST00000414968 558 ntTSL 42.45□□□□□ -2.022e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.21e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 SOAT2-202ENST00000542365 1797 ntTSL 218.2■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 CTTN-207ENST00000483662 736 ntTSL 26.27□□□□□ -1.418e-22■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 518.63■□□□□ 0.572e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.762e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 GNL3-212ENST00000497356 523 ntTSL 23.67□□□□□ -1.821e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 BRD4-204ENST00000594066 587 ntTSL 310.87□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.352e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PNISR-207ENST00000478777 2422 ntTSL 29.65□□□□□ -0.862e-34■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PNISR-206ENST00000476159 537 ntTSL 36.11□□□□□ -1.432e-34■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-34■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PNISR-203ENST00000460600 2178 ntTSL 24.99□□□□□ -1.612e-34■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.742e-34■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.598e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 513.31□□□□□ -0.288e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 C2-210ENST00000468407 694 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.753e-7■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 APOC4-APOC2-201ENST00000585685 1829 ntTSL 517.17■□□□□ 0.343e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 APOC2-201ENST00000252490 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.643e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 APOC4-APOC2-202ENST00000589057 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.763e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 APOC2-204ENST00000591597 447 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.23e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.483e-8■□□□□ 9.9
EFTUD2Q15029 NUP214-206ENST00000470765 620 ntTSL 58.6□□□□□ -1.037e-41■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NUP214-227ENST00000531929 593 ntTSL 41.73□□□□□ -2.137e-41■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NUP214-212ENST00000524578 524 ntTSL 31.71□□□□□ -2.147e-41■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-208ENST00000500634 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 PHYKPL-215ENST00000510913 643 ntTSL 38.27□□□□□ -1.099e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-209ENST00000528083 547 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.311e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.491e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.651e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.891e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NR1H2-205ENST00000595730 713 ntTSL 216.53■□□□□ 0.246e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NR1H2-209ENST00000597790 718 ntTSL 215.16■□□□□ 0.026e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NR1H2-212ENST00000600355 507 ntTSL 314.73□□□□□ -0.056e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 MTMR4-209ENST00000583656 810 ntTSL 323.01■■□□□ 1.273e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 HSF1-207ENST00000529630 646 ntTSL 221.07■□□□□ 0.967e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.557e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-212ENST00000496017 816 ntTSL 317.56■□□□□ 0.47e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.247e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-210ENST00000489138 548 ntTSL 315.01□□□□□ -0.017e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 MTMR4-205ENST00000580983 631 ntTSL 313.6□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.37e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-202ENST00000396706 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.37e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TMEM94-222ENST00000581834 484 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.367e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-207ENST00000474097 1604 ntTSL 512.54□□□□□ -0.47e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-209ENST00000483589 807 ntTSL 210.33□□□□□ -0.767e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 STAT3-206ENST00000471989 826 ntTSL 28.46□□□□□ -1.067e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 STAT3-209ENST00000498330 559 ntTSL 28.45□□□□□ -1.067e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 ZDHHC4-211ENST00000493944 641 ntTSL 28.14□□□□□ -1.117e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.137e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.317e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CYTH2-212ENST00000600597 293 ntTSL 56.36□□□□□ -1.397e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-202ENST00000572415 796 ntTSL 24.32□□□□□ -1.727e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-203ENST00000573087 851 ntTSL 34.32□□□□□ -1.727e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.777e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.777e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.897e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-209ENST00000575938 381 ntTSL 33.09□□□□□ -1.917e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -27e-10■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.213e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.523e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 213.54□□□□□ -0.243e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 NOP58-207ENST00000478941 508 ntTSL 35.49□□□□□ -1.533e-18■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 GPR107-206ENST00000483935 177 ntTSL 51.72□□□□□ -2.137e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 MDM2-216ENST00000471946 251 ntTSL 33.32□□□□□ -1.883e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 SLC26A6-215ENST00000466257 706 ntTSL 38.28□□□□□ -1.085e-42■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TTC7B-202ENST00000553948 630 ntTSL 530.21■■■□□ 2.431e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 PMS2P3-204ENST00000430602 1005 ntTSL 214.81□□□□□ -0.041e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CELSR3-204ENST00000498057 5297 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 CELSR3-202ENST00000461362 3633 ntTSL 510.32□□□□□ -0.762e-6■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 PMS2P3-208ENST00000533167 637 ntTSL 1 (best)8.54□□□□□ -1.041e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 HSPB11-206ENST00000489675 879 ntTSL 23.58□□□□□ -1.841e-8■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 UNC45A-204ENST00000471780 1730 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-9■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-203ENST00000392352 2172 ntTSL 225.59■■□□□ 1.692e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-205ENST00000443539 1756 ntTSL 223.09■■□□□ 1.292e-7■□□□□ 9.8
EFTUD2Q15029 EP400NL-202ENST00000389560 1726 ntTSL 1 (best)22.35■■□□□ 1.172e-7■□□□□ 9.8
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