Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 GREB1-207ENST00000432985 2052 ntTSL 1 (best)13.18□□□□□ -0.36e-7■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.956e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 220.73■□□□□ 0.916e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.866e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KDM5A-209ENST00000543507 575 ntTSL 420.22■□□□□ 0.836e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.826e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.736e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.646e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DDI2-205ENST00000546927 592 ntTSL 218.73■□□□□ 0.596e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.576e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ATP5D-204ENST00000589478 640 ntTSL 218.52■□□□□ 0.566e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EHMT1-212ENST00000483653 437 ntTSL 218.4■□□□□ 0.546e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PTBP3-201ENST00000210227 734 ntTSL 218.01■□□□□ 0.476e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PI4KAP1-203ENST00000612500 1869 ntTSL 217.82■□□□□ 0.446e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.391e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.351e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-205ENST00000470839 574 ntTSL 417.19■□□□□ 0.346e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DHRS11-213ENST00000615432 926 ntTSL 317■□□□□ 0.316e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MAU2-214ENST00000592069 558 ntTSL 416.94■□□□□ 0.36e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.77■□□□□ 0.286e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TNFAIP3-203ENST00000421450 421 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-204ENST00000455283 497 ntTSL 216.57■□□□□ 0.246e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-207ENST00000494702 856 ntTSL 316.17■□□□□ 0.186e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.176e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.116e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 STK25-221ENST00000462953 453 ntTSL 315.65■□□□□ 0.16e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHBDF2-207ENST00000590168 2665 ntTSL 1 (best)15.6■□□□□ 0.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NOB1-202ENST00000561677 582 ntTSL 215.57■□□□□ 0.086e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SH3TC1-223ENST00000513495 600 ntTSL 415.45■□□□□ 0.066e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ARRB1-208ENST00000531012 1744 ntTSL 215.41■□□□□ 0.066e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.046e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CPT1B-205ENST00000417176 558 ntTSL 414.9□□□□□ -0.026e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.036e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ATP5D-209ENST00000614837 343 ntTSL 214.66□□□□□ -0.066e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM131A-205ENST00000418768 812 ntTSL 314.64□□□□□ -0.076e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PTPRH-204ENST00000586852 680 ntTSL 314.57□□□□□ -0.081e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 RHPN1-202ENST00000522335 3656 ntTSL 1 (best)14.51□□□□□ -0.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-208ENST00000463131 674 ntTSL 514.47□□□□□ -0.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SH3TC1-212ENST00000507801 538 ntTSL 414.35□□□□□ -0.116e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TNFAIP3-204ENST00000433680 465 ntTSL 314.3□□□□□ -0.121e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CPT1B-208ENST00000460853 757 ntTSL 214.08□□□□□ -0.166e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.176e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.26e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-207ENST00000461371 1359 ntTSL 213.7□□□□□ -0.226e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DDI2-204ENST00000486680 1501 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.236e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BCL2L11-210ENST00000432179 572 ntTSL 413.54□□□□□ -0.246e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ARRB1-206ENST00000529741 404 ntTSL 313.52□□□□□ -0.256e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SMYD5-209ENST00000629411 246 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.256e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-205ENST00000479413 902 ntTSL 1 (best)13.24□□□□□ -0.296e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLEKHH1-201ENST00000329153 6604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.336e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EPB41L5-201ENST00000263713 6628 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.376e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 FAM131A-211ENST00000639617 4450 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.376e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.386e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.386e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-210ENST00000613925 1986 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.416e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.426e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-206ENST00000449301 1730 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.466e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HPS1-212ENST00000480020 795 ntTSL 512.02□□□□□ -0.496e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-204ENST00000473252 678 ntTSL 511.96□□□□□ -0.496e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPAS2-203ENST00000433408 1047 ntTSL 511.72□□□□□ -0.536e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-206ENST00000476700 2979 ntTSL 211.53□□□□□ -0.566e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-204ENST00000431118 2636 ntTSL 211.2□□□□□ -0.626e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CHKB-CPT1B-201ENST00000452668 546 ntTSL 411.09□□□□□ -0.636e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PLEKHH1-206ENST00000558386 3383 ntTSL 211.08□□□□□ -0.646e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PHKA2-205ENST00000473597 514 ntTSL 210.93□□□□□ -0.666e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-206ENST00000486911 3321 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.686e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-201ENST00000334731 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.736e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 PHKA2-207ENST00000481718 3115 ntTSL 210.35□□□□□ -0.756e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-201ENST00000275763 2973 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EPB41L5-204ENST00000443902 3167 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.776e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-205ENST00000443941 804 ntTSL 510.1□□□□□ -0.796e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-222ENST00000457025 413 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 ARAP1-215ENST00000542264 271 ntTSL 39.93□□□□□ -0.822e-15■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 AGBL3-203ENST00000436302 3533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.846e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DDI2-202ENST00000480945 10625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.856e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 HUWE1-206ENST00000463852 586 ntTSL 29.66□□□□□ -0.866e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-203ENST00000377031 1107 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.876e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 TNFAIP3-202ENST00000420009 698 ntTSL 39.38□□□□□ -0.911e-10■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DIP2B-203ENST00000546732 3514 ntTSL 29.38□□□□□ -0.916e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DHX16-204ENST00000480966 797 ntTSL 29.14□□□□□ -0.956e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GTF3C2-207ENST00000457098 762 ntTSL 38.86□□□□□ -0.996e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 C9orf85-202ENST00000377027 539 ntTSL 38.79□□□□□ -16e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -16e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GTF3C2-213ENST00000495298 1064 ntTSL 28.6□□□□□ -1.036e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-202ENST00000413606 770 ntTSL 38.53□□□□□ -1.043e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CDK13-205ENST00000484589 2111 ntTSL 1 (best)8.44□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 COPB2-202ENST00000502734 680 ntTSL 28.41□□□□□ -1.066e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 NPAS2-212ENST00000495559 3834 ntTSL 28.27□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 EPB41L5-202ENST00000331393 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.096e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 MFSD9-204ENST00000428085 576 ntTSL 58.13□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-202ENST00000428265 648 ntTSL 38.11□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CYP20A1-209ENST00000489360 601 ntTSL 58.11□□□□□ -1.116e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 DIP2B-201ENST00000301180 8593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.166e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 GTF3C2-205ENST00000431028 592 ntTSL 37.6□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-201ENST00000411670 675 ntTSL 57.26□□□□□ -1.253e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 KDM3B-204ENST00000507996 3034 ntTSL 26.34□□□□□ -1.396e-6■□□□□ 10.5
EFTUD2Q15029 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.43e-6■□□□□ 10.5
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