Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
A3GALT2U3KPV4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
A3GALT2U3KPV4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms