Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GJA3Q9Y6H8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GJA3Q9Y6H8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms