Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX8Q9Y5X2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SNX8Q9Y5X2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms