Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHOC2Q9UQ13 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHOC2Q9UQ13 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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