Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TNFSF18Q9UNG2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TNFSF18Q9UNG2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms