Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRPF19Q9UMS4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms