Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HPCAL4Q9UM19 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPCAL4Q9UM19 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms