Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CPA4Q9UI42 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPA4Q9UI42 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms