Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GPN3Q9UHW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms