Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2W1

PSMC3IP, Homologous-pairing protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC3IPQ9P2W1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMC3IPQ9P2W1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMC3IPQ9P2W1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms