Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL42Q9P2K6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
KLHL42Q9P2K6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms