Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMOD2Q9NZR1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMOD2Q9NZR1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMOD2Q9NZR1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms