Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRN3Q9NYV6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRN3Q9NYV6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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