Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT1Q9NXH9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRMT1Q9NXH9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms